九华山地藏菩萨道场形成以后，吸引了四方释子前来游参朝拜和驻锡修道，因此，山上除地藏和尚的旧有灵迹之外，后来又增建了许多寺庵。
 
明、清两代修建者尤多。截止于民国中期以前，全山佛寺（庵）已达150处左右，其中的9处为丛林，它们是：金地藏塔、化城寺、祗园寺、万年禅寺、甘露寺、上禅堂、东岩禅寺、乐善寺和慧居寺。其余为较小的寺庵，其分布情况是：以化城寺为中心，其东序（东寮）有6处，即九莲庵、旃檀林、通慧庵、天然庵、菩提阁、立庵；其西序（西寮）有7处，即佛陀里、宝积庵、长生庵、龙庵、永庆庵、天池庵、拱金阁；天台路有21处，即回香阁、华云庵、吉祥寺、长生洞、兴添寺、朝阳庵、翠云庵、崇兴寺、圆通庵、拜经台，地藏禅林、中常住（招隐庵）、正常住（德云庵）、老常住（护国寺）、真如庵、华严洞、接引庵、地藏庵、大悲庵、普济庵、延寿寺；化城东路有6处，即法华寺、沙弥庵、黄金庵、心安寺、伏虎洞、西天地；化城南路有7处，即净慧庵、三天门、转身洞禅室、二天门、正天门、一天门、崇觉寺；化城西路有3处，即小天台，建松树庵、西来庵；化城北路有24处，即聚龙寺、华天寺、万寿寺、半霄亭、龙池庵、燕子洞、二天门、大桥庵、西竺庵、一宿庵、无相寺、二圣殿、华阳亭、会龙庵、心庵、观音阁、回龙庵、小甘露庵、永丰庵、狮子林、观音庵、万缘庵、德云庵、通华庵。以上为当时“现存寺”，此外还有“废寺”67处。昔日九华山佛教之盛，由此可窥一斑。
 
九华山现存寺庙，主要者有：

九华山化城寺
 
化城寺，这是九华山地藏菩萨道场的开山祖寺，位于九华山的中心谷地，即今之九华街上。此谷地南有芙蓉峰，北有白云山，东为东崖，西为神光岭，四山环围，俨如城池。寺院始建于唐至德二年（757），寺成，金地藏应请自石室迁来居住。不久后，上首僧胜谕进一步扩充寺域，增建台殿、山门、放生池、供经台等。建中初（780），唐德宗敕赐寺额名“化城寺”。明宣宗（1426-1435）、神宗（1573-1620）、清圣祖（1662-1722）、高宗（1736-1795）或颁藏经，或御书匾额，并赐金修葺。咸丰七年（1857），除藏经楼外，寺宇皆毁于兵火。光绪年间（1875-1908）重建。殿宇依山而建，由低向高递进，“丹素交彩，层层倚空”，十分壮观。今寺分四进院，除藏经楼外，余均清代光绪年间建筑。以前，藏经楼不仅收藏有经书、诏书、宸翰真本，而且有据说是地藏穿过的袈裟、高约五尺的毗卢佛铜像、定光佛铁像、数枚铜质方印、重约数百斤的铜质独角兽（地听）、刻有地藏菩萨像的紫黑色石碑等珍贵文物。“文革”中，寺中佛像文物多被毁坏，今存者有古钟一口，重约二千余斤，藏经楼内又有白玉佛像、明版《涅槃经》、血写《华严经》等。寺前广场上有一千年古塘，当是《九华山化成寺记》中所说的“相水攸瀦，为放生池”的放生池。
 

 祗园寺
 
祗园寺，九华山“四大丛林”之一，全山佛寺之冠。原名祗树庵、祗园，位于九华街化城寺东，始建于明嘉靖年间（1522-1566），清代多次重修、扩建。嘉庆年间（1796-1820），隆山禅师在寺内开坛传戒，自此成为十方丛林。九华溪绕寺流过，溪上有“迎仙桥”。寺前甬道颇具特色，由雕刻着莲花、金钱图案的一百多石条铺设而成。寺内主要建筑大雄宝殿高约13丈，金黄色琉璃瓦屋顶，飞檐画栋，金碧辉煌。殿内像设庄严，所供的三尊金色佛像各高3丈，是九华山上最大的佛像，此外又有海岛观音像和刻着唐僧取经故事的7面浮雕。寺内又有八口大锅，其中最大一口口径丈余，一锅可供千人斋饭。
 

 百岁宫
 
万年禅寺，俗称百岁宫。名列九华山“四大丛林”之中，位于九华山摩空岭上。寺碑载，明万历年间（1573-1620），有僧海玉，号无瑕，由五台山至九华，在此岭摘星亭旁结茅而居，因亭而名庵，百岁而终，时人称其为“百岁公”，同时在旧庵处改建成宫室，以兹纪念。崇祯皇帝封海玉为“应身菩萨”，又御笔亲书“护国万年寺，钦赐百岁宫”10字赐之。寺名因此而来。现存寺宇依山势建为五层楼阁，东傍悬崖，西临幽谷，危岩宝殿，气势非凡。寺内肉身殿供奉着海玉和尚的装金肉身（木乃伊）。
 

九华山东崖云舫
 
东岩寺，九华山“四大丛林”之一。位于化城寺东三里许的东崖上。峭壁如削曰崖，崖中洞室曰岩。相传地藏和尚初至九华山，即在此东崖的岩洞中习定修法，洞名东岩，又称地藏洞、金光洞、舍身岩、舍生岩等，都是就地藏在此修习的不同传说而命名。明弘治十五年(1502)，王阳明第一次来此游玩；正德十四年(1519)再次入山，并于此岩洞中晏坐读书。此外还有异僧周经也继地藏之后幽栖于此洞。万历间(1573—1620)，将崖顶上祭祀地藏和尚的晏坐堂改建成寺院，并因洞而名寺。1933年，寺毁于火，唯存钟亭及幽冥洪钟。寺附近有巨石似艨艟巨舰，故名“云舫”。站在东崖上，东望天柱五老诸峰，西顾古仙岩诸胜，南瞻天台，北览长江，天然图画，尽收眼底。
 
甘露寺，九华山“四大丛林”之一。位于九华山北半山腰上。此地山水环绕，茂林修竹，遮天蔽日。清康熙六年(1667)，玉琳国师奉旨到九华山进香，行至此地，见风景奇秀，乃说：“此处筑兰若，必代有高僧”。伏虎寺(即东岩寺)和尚洞安据此建议募缘集资建寺，动工之日，满山林木翠竹尽挂甘露，佛经以“甘露”为诸天不死之药，食者命长身安，力大体光；又以“甘露法门”譬喻为“最上之法”，因此，洞安和尚遂兼取祥瑞和经义取名甘露寺。寺因山势而建，殿宇五层，皆金色琉璃瓦顶。万绿丛中，红柱金光隐约，颇富诗情画意。寺旁有“定心石”，传说地藏和尚曾趺坐石上入定，蛇来不惊魂，女诱心不动。

肉身塔殿供奉的地藏和尚金色坐像
 
肉身塔殿，位于九华山神光岭上，神光岭即古之“南台”。费冠卿《九华山化成寺记》载，地藏和尚在化城寺建成后，仍坚持苦修，每岁夏季皆率一徒居于南台自织麻衣。他入寂之后，弟子们即在这里建立肉身塔供养。塔成，发光如火，圆形，称“圆光”，后人遂改南台为神光岭。原塔为三级小浮图，后人复以木塔笼护，外建高殿以挡风雨、壮观瞻。千余年来，塔殿兴废相替，屡有修葺。其中，明万历间，皇帝曾赐名“护国肉身宝塔”，并赐金修建。清代也有多次维修。同治年间（1862-1874）塔殿毁于山洪。光绪年间（1875-1908）复作大规模整修，至今基本保持原貌。现存肉身殿成方形，宽长各5丈，高约6丈。殿顶用铁瓦覆盖，并由回廊内外20余根石柱支撑。重檐斗拱、画栋雕梁，风铎丁当，十分壮美。殿前廊下高悬“东南第一山”金字匾，前后门门楣上方竖挂“肉身宝殿”青花古瓷匾。殿内中央肉身塔，笼护木塔为七层八角形，高约17米，内壁用赤金贴写《地藏本愿经》，外壁涂以朱漆，每层每面均设佛龛，龛龛供奉地藏和尚金色坐像。木塔内即石砌的三级肉身塔。殿内两侧分列十王金色立像。殿内地面、塔基、神座皆用汉白玉或铺或砌，浑然一体，既给人圣洁之感，又用极强的反差衬托出朱塔、金像的辉煌庄严。塔前悬挂的镂空八角琉璃灯长明不灭。肉身殿是九华山的开山祖坟所在地，与化城寺同为此一地藏菩萨道场的法事重地和中心建筑，是进山僧尼、信士乃至一般游客必到之处。每逢地藏和尚的生日和成道日，僧尼、信士便蜂拥至此上供，不舍昼夜守塔、绕塔诵经礼拜。
 
上禅堂，位于九华山神光岭肉身殿下。原名景德堂，清康熙年间，玉琳国师弟子宗衍扩建寺宇，并改名上禅堂，从前后的名字看，应为禅宗寺院。此寺山门不大，但殿宇宽广，环境清幽，在九华山寺庙中，此寺香火最旺，风景最佳、殿宇最丽。寺旁的金沙泉、洗砚池、九华三宝之一的金钱树传说多与唐代诗人李白有关。
 
天台寺，位于天台峰(即天台正顶)捧日亭北，另名地藏禅林，明代创建，清代光绪间重修，与百岁宫、甘露寺一样，依山势建为五进楼阁，主要建筑有万佛楼，楼内梁、壁间雕有无数小佛像，故名。此外又有地藏殿，殿内供奉地藏和尚像。明清时期，默安禅师住寺，僧尘尘子在寺旁结茅而住，名活埋庵。民国九年(1920)，僧彻德住持，重建佛殿，新订规制较昔整齐。民国二十七年前后，由僧明辉住寺。