建宁寺是古代南宁九庵十八寺之一,古时与青秀山山上的观音寺、水月庵、孔庙、天宁寺等寺庙齐名。建宁寺始建于宋朝年间的古寺,有近千年历史,原名镇宁寺,原址位于望仙坡镇宁炮台附近(现虎邱小学内),是一座三进两廊的寺庙,当时的镇宁寺就像南宁的水街、望火楼、东门、南门、北门、仓西门\城隍庙、钟鼓楼等地名一样家喻户晓,无人不知,烂熟于耳。
南宁城市面积古代是“直城三里七,横城七里三”,镇宁寺的位置处于城外不远的望仙坡上,应该说是离当时的城墙不远,而且寺里常年住着和尚打理佛事,逢初一、十五,各方信众纷纷前去上香祈福。所以香火旺盛。。
1939年8月30日,日本出动轰炸机12架空袭南宁市,将建宁寺夷为平地,日本投降后曾两迁四建,2007年1月迁至建宁寺现在的所在地明秀东路虎丘村青松岭,盖有简易堂一座。2011年,该寺筹集善款280万元重建昔日被日本人炸毁的建宁寺大雄宝殿。