水晶的评价标准和高端宝石有所不同。多数高端宝石把颜色放在评价的第一位，而对水晶来说，颜色和净度（水晶行业称作晶体）是近乎同等重要的因素。
1、颜色：对任何宝石来说，颜色都是非常重要的，水晶也不例外。如果是水晶晶体是有颜色的，如粉水晶、黄水晶、紫水晶等，其颜色评价的最高标准则是明艳动人，不带有灰色、黑色、褐色等其他色调。如粉水晶，颜色以粉红为佳；紫水晶，要求颜色为鲜紫，纯净不发黑；黄水晶，要求颜色不含绿色、柠檬色调，以金橘色为佳。对于发晶来说，晶体的颜色也是很重要的。相同发丝的金发晶，晶体完全无色（白水晶）和晶体略偏茶色，肉眼的视觉观感也是有差别的，所以前者的价格会高于后者。
2、净度：水晶与高档宝石的净度要求有很大不同。高档宝石稀少罕见，所以一般人们普遍对高档宝石的净度不会过于苛求。而水晶的产量着实大得惊人，所以通常人们会要求水晶净度越高越好，尽量避免有较明显的内含物的水晶。
3、杂质：如果水晶内部杂质中有传说中人物的造型，如佛、星座、生肖等价值可能要高于同等颜色和净度的水晶。
深橙色的黄水晶被视为是最有价值的，因为它的颜色浓郁且 醇厚，给人一种皇家般尊贵的感觉。在我国的古代，皇帝的服装就是这种颜色，平民百姓绝对禁止使用这种皇家专属的颜色。但鲜艳亮眼略带些微绿色调的柠檬色也非常受欢迎。黄水晶若净度不高，或颜色带有灰色、茶色调，价格就会降低。黄水晶最主要的产地是在巴西，且品质也较高。不过国内市场上很多的黄水晶是由紫水晶加热褪色后制成的。
国内市场上很多的黄水晶是由紫水晶加热褪色后制成的，颜色较淡，且没有美艳之感，色调显得有些单薄。虽然都是石英，但一般认为这类黄水晶的价值没有天然黄水晶的高。对于颜色很浅的黄水晶，有些珠宝商也会通过辐照来加强宝石的颜色，使宝石看起来更艳丽。这类品相的黄水晶，数量较多，价格也比较便宜，而且其颜色在正常的室温下，是永远不变的，所以普遍地被社会大众所接受。
（一）看选料：选料精良的水晶制品，应看不到星点状、云雾状和絮状分布的气液包体。质地纯净、光润、晶莹为好，如果发现有深浅不一的断裂纹、斑点，则属于次品。
（二）看做工：水晶制品加工过程分为两种，即磨工和雕工。如水晶项链、手链、耳环等属于研磨品；观音像、内画鼻烟壶等属于雕刻品。一件做工好的水晶制品应考究精细，不仅能充分展现出水晶制品的外在美(造型、款式、对称性等)，而且能最大限度的挖掘其内在美(晶莹、巧色)。
（三）看抛光：抛光的好坏直接影响到水晶制品的身价。水晶在加工过程中须经过金刚沙的琢磨，粗糙的制作会使水晶表面存在磨擦的痕迹。好的水晶制品自然透明度、光泽都比较好，按地话说法“火头足”。
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