南海佛学院目前已设有汉传佛学系、佛教音乐系、佛教美术系、佛教管理系、佛教建筑系和1个佛教研究所。今年共有8个本科专业招生，分别为汉传佛学专业、佛教音乐专业、佛教美术专业、禅茶专业、寺院管理专业、社会工作与慈善管理专业、佛教建筑保护与设计专业以及佛学与生命科学管理专业，首批招收了227名学生。
南海佛学院是国家宗教事务局批复建设，由海南省民宗委主管、海南省佛教协会主办的四年制本科佛教学院。根据总体构想，南海佛学院将建设一个立足国内，面向东南亚与港澳台地区，集“学历教育、佛学禅修、业余培训、佛教文化研究和对外交流”为一体的复合型佛学院。
中国佛教协会副会长、南海佛学院院长印顺大和尚说，南海佛学院的创办，旨在加强与南海周边国家佛教文化交流，满足广大佛教信众需求，打造面向东南亚的佛教文化交流基地。学院面向海内外聘请优质师资，秉承爱国爱教、信仰虔诚、学修并重的精神，不仅培养弘法利生、荷担如来家业的法门龙象，而且要培养与时俱进，适应国家和社会需求的各类人才。
蒋坚永表示，希望南海佛学院立足海南，面向世界，建设成为国内领先、国际一流的佛学院。海南省在与南海周边国家的交流交往中具有得天独厚的条件，南海佛学院要扩大与南海周边国家佛教界的交流交往、互学互鉴，丰富和拓展交流内涵，在促进传统友谊，推动民心相通，传播中华优秀传统文化、服务“一带一路”建设等方面发挥积极作用，努力打造成为中国重要的对外佛教文化交流基地和南海佛教交流中心。
出席开学典礼的还有来自蒙古国、老挝、泰国、缅甸、尼泊尔、柬埔寨、英国、澳大利亚、日本、印度等国家和台湾、香港地区的高僧和代表。多位国际佛教大学负责人对南海佛学院的未来寄予很高期望。印度那兰陀大学原校长、现任乔达摩大学名誉校长拉文达·潘思表示，当今世界共同面临气候变暖等方面的挑战，非常愿意与南海佛学院合作，相互取长补短，为人类共同面临的问题寻找佛陀的智慧。
