每次听课完毕回向后，我们都会念「愿消三障诸烦恼，愿得智慧真明了，普愿灾障悉消除，世世常行菩萨道。」
这里所说的三障是指：
一、烦恼障（含摄性障）
障碍有情出离分段生死的烦恼，也就是见惑与思惑，由于这两种烦恼不能断尽，使得众生无法出离三界生死苦。
其中所含摄性障，性障则是指五盖，也就是贪欲、嗔恚、睡眠、掉悔和疑等，这五个法会障碍学人证得四禅八定，或者障碍学人修证解脱道，所以称为五盖。
二、所知障
因为对法界实相正理的无知，导致无法证知法界的真实相，无法证知一切法的根源，因此而无法成就佛道，也可以说是对于法界实相的所知不足，所以成为佛道上的障碍。
三、业障
因为往世迷理迷事，而造作了恶业，业种会障碍菩萨行道，也会障碍初机菩萨修学佛法，这都是因为往世所造恶业种子的现行，而使得新学菩萨初始学佛的时候，处处产生障碍，这就是业障。
那我们应该如何忏悔呢？
先来讲述一个真实的故事，佛教史上鼎鼎有名的菩萨是《百法明门论》的论主 世亲菩萨，又被称为 天亲菩萨。
世亲菩萨于佛灭度后九百年，出生于北印度的健驮罗国，有兄弟各一人，兄长即是后来的无着菩萨，兄弟三人都出家修行。世亲菩萨最初是在小乘萨婆多部出家，博学多闻，遍通小乘三藏，广造小乘论著，大肆宣扬小乘教义，并且主张大乘非佛说，不信大乘法。世亲菩萨的兄长无着菩萨，看见弟弟长此下去，恐怕他会造论来破坏大乘佛法，于是有一天他就派遣侍者去告诉世亲菩萨说：「你哥哥病得很严重，恐怕不久于人世，希望你赶快去见他最后一面。」于是世亲菩萨连忙赶到兄长住处，无着菩萨就说：「我的病是心病，这个病是因你而起，由于你不信大乘，而且常常毁谤大乘，以此恶业未来必将永远沉沦在恶道中受苦。我正是为了你，而感到愁忧苦恼不已。」世亲菩萨听了以后，内心感到十分的震惊和恐惧，马上敦请无着菩萨为他解说大乘佛法。
由于世亲菩萨一向聪颖睿智，一听立刻领悟到大乘教理确实是超越于小乘，因此转而信奉大乘。从此以后便在无着菩萨的座下遍学大乘法，凡为解说无不通达，这才知道自己从前谬赞小乘，毁谤大乘，误人误己，实在是罪业深重，于是便在无着菩萨面前发露忏悔说：「我从前因为这片舌头的缘故，而妄生毁谤大乘佛法，现在应当割断舌头以赎前愆。」无着菩萨说：「你这就不对了，即使你将舌头割下来，也不能消灭毁谤大乘之罪业。你如果想要灭罪，另外有善巧的方便法门。」世亲菩萨马上请无着菩萨为他解说灭罪补救之方法，无着菩萨说：「你以舌头毁谤大乘，如果要灭除这个罪业，也应当以舌头转而弘扬大乘，赞叹大乘的殊胜妙义。」
从此以后世亲菩萨就专心的宣扬大乘，广造诸论阐扬大乘佛法，对瑜伽宗的许多论著也详加论述，凡是世亲菩萨所造之经论，文义皆极为精妙，若有见闻之人，普皆为之信仰叹服。乃至如今二十一世纪的我们，仍然受到世亲菩萨的德泽所被，得以修学唯识妙义，使世尊的如来藏法，得以继续普照娑婆世界，广度有缘之众生。
我们被世亲菩萨这种勇于忏悔、改往修来的勇气所深深的折服。菩萨在一世又一世的学法修道过程之中，只要还有隔阴之迷存在，就难免会误造诸业而自障障他，因此如何在造诸恶业之后，懂得惭愧与忏悔，就是修道能否顺利推进的关键所在了。
佛在经中曾说：「若人造重罪，作已深自责，忏悔更不造，能拔根本业。」
忏悔乃是善法，我们在忏悔时应该要知道忏悔的精神与要领。忏就是发露，悔则是永不復作，若能如法忏悔，功德无量无边。如犯重戒，必须在佛前对众忏，若是轻戒则必须在佛前对首忏，若是小戒则只需在佛前自责其心就可以。在如法实行上述忏法以后，必须如实的遵守悔法，也就是永不復作，并且进一步转而努力护持正法利益众生。譬如前面我们所说世亲菩萨的例子，就是我们最好的学习榜样。
另外像拜大悲忏、八十八佛忏、三千佛忏，乃至万佛忏，也都是可以选择的拜忏法门，或者诵唸地藏王菩萨圣号，持诵《地藏菩萨本愿经》等，也都是方便又效果显著的忏悔业障好方法。菩萨们在拜忏或诵经忏悔时，当以至诚心恭请诸佛菩萨为我们作证明，自己则改往修来，勇发大菩提愿，行菩萨道以利众生，能够如此至心忏悔，必定能够感应诸佛菩萨，为我们加持灭罪。
大妄语业、谤菩萨藏、谤胜义菩萨僧当如何忏悔：
其一：未悟言悟、未得言得之人，可说是所在多有，数之不尽，这只是犯了大妄语业，而不曾毁谤正法与贤圣忏悔起来相对比较简单，只须公开声明以前所谓的开悟是错误的，并且转变心态，努力宣扬正法知见，此世的大妄语业，就可以消灭于无形。所以请您不必太恐慌，只须公开忏悔并且努力护持正法的弘扬就可以免除大妄语的地狱业，也可以使自己的道业因此而增上。这是您可以作，也是您应该作的事。
其二：为了维护个人错误的开悟身分，转而毁谤真正开悟的人，或者毁谤如来藏了义正法，那就难以善了，如果是这样的话，就只有一条路可以走，那就是公开的忏悔谤法、谤贤圣的过失，并且尽形寿护持正法。公开宣示：尽未来际都要努力护持正法，永不再造毁谤正法以及贤圣的业。才有可能消除地狱重罪，同时必须每天在佛前殷重忏悔，努力护持正法。如是日日忏悔而见好相时，才能灭罪。
护持正法 累积福德
这些年来，海峡两岸邪师说法如恆河沙，到处可见大法师以常见外道见在误导众生，或是假藏传佛教以邪淫、乱伦、杂交的外道法混入佛门。而这些错悟的见解，在平实导师书中，都有详细的解说和辨正，您如果愿意努力向他人推荐平实导师的正法书籍，努力向他人推荐正觉同修会所弘扬的八识论正知正见，这一世努力护持正法的结果，不仅能使您免除下地狱的果报，一定也可以使您有亲证如来藏的因缘。
发大心 真忏悔
一般来说人们所造的恶业，大多是为了自身的利益，而以身口意行伤害其他有情众生者居多，严重者则是谤佛、谤法和毁谤贤圣等，以致造成今生不管是生活、学法或者是修道，都因为身心的种种痛苦遮障而不得自在。从佛法的角度来说，惭愧和忏悔都是善法，因此在生命过程中，如果我们曾经对其他有情犯过不好的身口意行，应该如法忏悔，也就是心生惭愧而发露忏悔，并且发愿永不復作。如果是亏欠众生者，则应该努力去弥补自己的过失，在如法忏悔以后，愿意断恶修善、改往修来，并且愿意尽形寿如说而行，发大愿心、行菩萨道、救护众生，并且时时透过戒法来警惕自己，这样就能够世世增益自己在佛道上的进程，这也是一切发大心真忏悔的菩萨所当为、所应为。
