从晶洞的成因类型来看，可分为伟晶岩型、热液型（岩浆热液型、与火山活动有关的热液型及与岩浆活动无直接关系的热液型）。另外，在外生作用条件下，风化淋滤作用也可形成晶洞。
1、花岗伟晶岩型
在花岗伟晶岩体膨胀部分的中心部分，可形成晶洞，带有水晶及黄玉、海蓝宝石、碧玺等宝石矿物出产。
伟晶岩的形成是个长期而复杂的过程，所形成的温度变化范围较大（600℃～200℃）。伟晶岩体中心部位晶洞中的矿物形成晚，温度低。
2、热液型
形成晶洞矿物的热液是多来源的。有的来自深部的岩浆热液，还有的来自地下与岩浆活动无直接关系的热水溶液，由于热液中物质成分不同及其地质环境不同，因而形成了不同矿物成分的晶洞。
热液型晶洞形成的温度变化范围较大（400℃～50℃）。
3、风化淋滤型
在风化作用下，地表的岩石或矿石受大气、水、生物等的影响，溶解后被运移到裂隙或空洞中，沉积形成晶洞矿物。
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