绿色碧玺在历史上很长一段时间被当作祖母绿而开发利用，直到后来电气石的特性被发现，绿碧玺与祖母绿才被区分开来。绿色碧玺从颜色上来看主要有两种：一种是颜色深绿的碧玺，另一种是黄绿色的碧玺。这两种绿碧玺里与祖母绿颜色接近的是深绿色的碧玺。祖母绿的颜色一般呈深翠绿色，或呈带蓝的绿色。这两种深绿色的宝石之间的确具有很大的相似性！但是因为两种宝石的光学性质差异，祖母绿和绿色碧玺之间可以从光感上来鉴别区分。

从光色质感上来比较：绿色碧玺的内部光色要比祖母绿暗，切割好的宝石之间相比差别更为明显，切面的碧玺宝石显得深沉些，而祖母绿宝石在翠绿的颜色中闪烁着明亮的光色，相比更有活力！
从包裹体来看：祖母绿宝石的内部包裹体要比绿色碧玺宝石的包裹体多且复杂。一般市场上的祖母绿宝石都有明显的内部包裹体，而绿色碧玺因为产量比较大，所以在选料的上都比较纯净。
从宝石切割上看：祖母绿宝石因为质地极其脆硬，所以一般都采用典型的祖母绿式切割，而碧玺宝石的切割方法比较多，宝石形状更为丰富！
由此，我们可以总结出绿色碧玺和祖母绿在肉眼上有这几点较为明显的差别：祖母绿较绿碧玺颜色更为翠，光感更为活；祖母绿的包裹体∠绿色碧玺要多；祖母绿宝石一般都是祖母绿式(方形)切割，而绿碧玺的切割形状多种多样！通过这些肉眼特征的比较相信绿色碧玺和祖母绿宝石我们也可以通过肉眼来鉴别了。
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