但由于目前自行参与放生的市民对放生的认识参差不齐，出现了一些不规范的放生行为，如放生巴西龟等禁放物种；活鱼、死鱼、病鱼一并放生；放生中出现了丢弃垃圾及以盈利为目的等不良行为。不规范的放生行为破坏和影响水质显而易见，如放生属于食肉鱼的银鱼，将造成对净化水质有好处的鱼种数量减少，进而影响水质。
市政协委员张祖平呼吁，提倡科学放生，从我做起。放生中要做到：放生鱼种的来源要有所选择，要选择健康的鱼种，不能选择有寄生虫和传染病的鱼种，在水源保护区放生前应该对鱼体健康状况进行观察检测或检疫检验，确保没有病害。在运输过程中要保证环境相对稳定，否则会导致成活率降低，放生前要让鱼种逐渐适应放生处的水环境和水温等。同时，从自我做起，从身边做起，做到群体性的放生活动实行报备制；加大科学放生的宣传力度。委员们呼吁，参与或组织放生，不仅要有慈悲心，还要有智慧和必要的知识，慎重实施。这样既能合理表达自己的慈悲心，积累功德，又能避免善事变恶事或造成新的生态问题，为外界所诟病。
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